Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHRNB3Q05901 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms