Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CACNA1BQ00975 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms