Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CRB1P82279 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB1P82279 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB1P82279 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB1P82279 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB1P82279 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB1P82279 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB1P82279 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB1P82279 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB1P82279 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB1P82279 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB1P82279 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB1P82279 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB1P82279 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB1P82279 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB1P82279 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB1P82279 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB1P82279 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB1P82279 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CRB1P82279 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB1P82279 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB1P82279 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB1P82279 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB1P82279 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB1P82279 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB1P82279 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB1P82279 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB1P82279 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB1P82279 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB1P82279 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB1P82279 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB1P82279 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB1P82279 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB1P82279 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB1P82279 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CRB1P82279 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRB1P82279 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRB1P82279 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRB1P82279 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRB1P82279 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRB1P82279 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CRB1P82279 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRB1P82279 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CRB1P82279 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRB1P82279 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CRB1P82279 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CRB1P82279 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CRB1P82279 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CRB1P82279 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CRB1P82279 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRB1P82279 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRB1P82279 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRB1P82279 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRB1P82279 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRB1P82279 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRB1P82279 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRB1P82279 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRB1P82279 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRB1P82279 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRB1P82279 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRB1P82279 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRB1P82279 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRB1P82279 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CRB1P82279 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB1P82279 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB1P82279 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB1P82279 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB1P82279 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB1P82279 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB1P82279 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB1P82279 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB1P82279 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB1P82279 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB1P82279 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB1P82279 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB1P82279 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB1P82279 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB1P82279 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB1P82279 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB1P82279 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CRB1P82279 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CRB1P82279 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms