Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS28P62857 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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