Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P61576 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms