Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ERVS71-1P61550 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms