Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPS3AP61247 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS3AP61247 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms