Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN17P56750 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN17P56750 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms