Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTBP2P56545 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBP2P56545 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBP2P56545 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBP2P56545 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBP2P56545 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBP2P56545 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBP2P56545 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBP2P56545 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBP2P56545 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBP2P56545 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBP2P56545 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBP2P56545 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTBP2P56545 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBP2P56545 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBP2P56545 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBP2P56545 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBP2P56545 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTBP2P56545 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms