Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASP7P55210 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP7P55210 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP7P55210 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CASP7P55210 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP7P55210 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP7P55210 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP7P55210 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP7P55210 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP7P55210 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP7P55210 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP7P55210 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP7P55210 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP7P55210 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP7P55210 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASP7P55210 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASP7P55210 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP7P55210 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP7P55210 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP7P55210 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP7P55210 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP7P55210 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP7P55210 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP7P55210 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP7P55210 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP7P55210 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP7P55210 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP7P55210 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP7P55210 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP7P55210 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP7P55210 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP7P55210 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CASP7P55210 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms