Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP1B3P54709 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATP1B3P54709 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms