Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP98P52948 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP98P52948 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP98P52948 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP98P52948 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP98P52948 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP98P52948 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP98P52948 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP98P52948 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP98P52948 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP98P52948 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP98P52948 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP98P52948 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP98P52948 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP98P52948 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP98P52948 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP98P52948 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP98P52948 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP98P52948 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP98P52948 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP98P52948 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP98P52948 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP98P52948 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP98P52948 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP98P52948 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP98P52948 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP98P52948 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP98P52948 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms