Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CENPAP49450 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CENPAP49450 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CENPAP49450 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms