Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC4A3P48751 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A3P48751 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms