Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TSFMP43897 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TSFMP43897 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TSFMP43897 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms