Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AFMP43652 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AFMP43652 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
AFMP43652 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AFMP43652 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms