Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3CBP42338 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms