Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK1P39086 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK1P39086 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms