Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FDFT1P37268 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms