Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HOXA7P31268 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA7P31268 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms