Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GABRB3P28472 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms