Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMB4P28070 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms