Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PSMB9P28065 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms