Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HMGB2P26583 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB2P26583 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms