Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DNMT1P26358 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms