Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2AP24928 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLR2AP24928 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms