Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRGP23470 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRGP23470 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
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