Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TAF1P21675 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TAF1P21675 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1P21675 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1P21675 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1P21675 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1P21675 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1P21675 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1P21675 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1P21675 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1P21675 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1P21675 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1P21675 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1P21675 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1P21675 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1P21675 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1P21675 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1P21675 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1P21675 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1P21675 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TAF1P21675 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TAF1P21675 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1P21675 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1P21675 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1P21675 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1P21675 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1P21675 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1P21675 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1P21675 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1P21675 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1P21675 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1P21675 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1P21675 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1P21675 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1P21675 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1P21675 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1P21675 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF1P21675 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms