Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HOXA5P20719 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HOXA5P20719 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HOXA5P20719 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
HOXA5P20719 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
HOXA5P20719 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HOXA5P20719 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HOXA5P20719 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HOXA5P20719 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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HOXA5P20719 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
HOXA5P20719 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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HOXA5P20719 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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HOXA5P20719 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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HOXA5P20719 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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HOXA5P20719 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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HOXA5P20719 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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HOXA5P20719 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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HOXA5P20719 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
HOXA5P20719 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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