Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP4AP20648 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP4AP20648 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP4AP20648 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP4AP20648 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP4AP20648 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP4AP20648 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP4AP20648 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP4AP20648 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP4AP20648 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP4AP20648 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP4AP20648 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4AP20648 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP4AP20648 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms