Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCNA2P20248 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCNA2P20248 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms