Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CXCL3P19876 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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