Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATF3P18847 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATF3P18847 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATF3P18847 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF3P18847 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF3P18847 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF3P18847 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF3P18847 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF3P18847 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF3P18847 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF3P18847 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF3P18847 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF3P18847 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATF3P18847 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF3P18847 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF3P18847 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF3P18847 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF3P18847 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF3P18847 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF3P18847 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF3P18847 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF3P18847 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF3P18847 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF3P18847 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF3P18847 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF3P18847 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF3P18847 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF3P18847 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF3P18847 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF3P18847 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF3P18847 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATF3P18847 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATF3P18847 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATF3P18847 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATF3P18847 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms