Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XBP1P17861 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
XBP1P17861 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
XBP1P17861 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
XBP1P17861 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
XBP1P17861 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
XBP1P17861 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
XBP1P17861 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms