Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTPS1P17812 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms