Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMD1P17707 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMD1P17707 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMD1P17707 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMD1P17707 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMD1P17707 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMD1P17707 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMD1P17707 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMD1P17707 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMD1P17707 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMD1P17707 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMD1P17707 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AMD1P17707 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AMD1P17707 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AMD1P17707 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMD1P17707 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMD1P17707 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMD1P17707 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMD1P17707 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AMD1P17707 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AMD1P17707 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMD1P17707 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMD1P17707 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMD1P17707 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMD1P17707 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AMD1P17707 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms