Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNA6P17658 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNA6P17658 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms