Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCFC2P16383 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms