Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms