Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTN1P12814 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTN1P12814 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms