Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RLBP1P12271 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms