Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GLI4P10075 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GLI4P10075 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms