Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HKR1P10072 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HKR1P10072 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms