Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
TRAPPC2BP0DI82 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRAPPC2BP0DI82 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms