Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ86

DUX4L3, Double homeobox protein 4-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L3P0CJ86 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUX4L3P0CJ86 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DUX4L3P0CJ86 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms