Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR89BP0CG08 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR89BP0CG08 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR89BP0CG08 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR89BP0CG08 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR89BP0CG08 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR89BP0CG08 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR89BP0CG08 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR89BP0CG08 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR89BP0CG08 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR89BP0CG08 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR89BP0CG08 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR89BP0CG08 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR89BP0CG08 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR89BP0CG08 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR89BP0CG08 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR89BP0CG08 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR89BP0CG08 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GPR89BP0CG08 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms