Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4AP0C0L4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms