Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB7P09629 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms