Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GJB1P08034 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GJB1P08034 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GJB1P08034 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GJB1P08034 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GJB1P08034 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB1P08034 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB1P08034 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB1P08034 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB1P08034 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB1P08034 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB1P08034 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GJB1P08034 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms