Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBP07199 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBP07199 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBP07199 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CENPBP07199 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBP07199 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBP07199 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBP07199 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBP07199 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms